Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms