Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Copg1Q9QZE5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms