Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndrg3Q9QYF9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms