Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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