Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Abcb11Q9QY30 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Abcb11Q9QY30 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcb11Q9QY30 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms