Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp3Q9QY23 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms