Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nufip1Q9QXX8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms