Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms