Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clca3a1Q9QX15 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3a1Q9QX15 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms