Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Homer2Q9QWW1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms