Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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