Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PdcQ9QW08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms