Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms