Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms