Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms