Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms