Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep6Q9JM62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep6Q9JM62 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms