Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rabgef1Q9JM13 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabgef1Q9JM13 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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