Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole3Q9JKP7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole3Q9JKP7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms