Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp39a1Q9JKJ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms