Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms