Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms