Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ybx3Q9JKB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms