Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpa33Q9JKA5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpa33Q9JKA5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpa33Q9JKA5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms