Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tuba8Q9JJZ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms