Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcl1Q9JJT0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms