Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms