Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl1Q9JI74 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl1Q9JI74 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl1Q9JI74 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl1Q9JI74 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl1Q9JI74 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl1Q9JI74 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl1Q9JI74 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms