Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtaQ9JHK4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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