Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc40a1Q9JHI9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc40a1Q9JHI9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms