Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn2Q9ER65 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms