Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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