Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tlr9Q9EQU3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms