Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold3Q9EQ28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pold3Q9EQ28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms