Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf1Q9EPU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms