Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms