Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt7Q9DCV7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt7Q9DCV7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms