Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl4Q9DCU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms