Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufa8Q9DCJ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufa8Q9DCJ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufa8Q9DCJ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms