Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop7Q9DCH2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms