Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc97Q9DBT3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms