Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms