Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DA42 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9DA42 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9DA42 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9DA42 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9DA42 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9DA42 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DA42 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DA42 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DA42 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DA42 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DA42 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DA42 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms