Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd8Q9DA37 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms