Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smco2Q9DA21 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms