Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg7Q9D906 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms