Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Erp27Q9D8U3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Erp27Q9D8U3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms