Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms