Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl4Q9D8E6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms