Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms